تأسست جامعة فهد بن سلطان الأهلية عام 2003م بمبادرة من صاحب السمو الملكي الأمير فهد بن سلطان -أمير منطقة تبوك- بإنشاء جامعة أهلية لنشر الثقافة والعلوم في مدينة تبوك لما لها من موقع جغرافي متميز يخدم المنطقة وما حولها. ويشرف على الجامعة مجلس أمناء يرأسه الأمير فهد بن سلطان بن عبد العزيز ومجلس الجامعة.